Tại báo cáo gửi đến Kỳ họp thứ 10, Quốc hội khóa XIV, ông Hồ Đức Phớc - Tổng Kiểm toán Nhà nước chỉ ra những bất cập trong quản lý, sử dụng vốn đầu tư một số dự án BT thuộc Khu đô thị mới Thủ Thiêm (TP.HCM).Kết quả kiểm toán năm 2020 về việc quản lý, sử dụng vốn đầu tư các dự án này cho thấy, chất lượng lập tổng mức đầu tư chưa tốt, còn bất cập. Dự án Xây dựng hạ tầng kỹ thuật khu dân cư phía bắc có tổng mức đầu tư được duyệt là 3.345,6 tỷ đồng, tuy nhiên giá trị hợp đồng BT được ký kết chỉ là 2.641,3 tỷ đồng. Giá trị dự toán tiếp tục được cơ quan quản lý nhà nước và nhà đầu tư xác định lại hợp đồng BT còn 1.776,5 tỷ đồng (bằng 53% tổng mức đầu tư ban đầu).

Dự án đầu tư xây dựng cầu Thủ Thiêm 2 có tổng mức đầu tư được duyệt là 4.260,1 tỷ đồng, giá trị hợp đồng BT được ký kết là 3.082,4 tỷ đồng, giá trị dự toán là 2.504,5 tỷ đồng (bằng 58,7% tổng mức đầu tư ban đầu).Dự án đầu tư xây dựng 4 tuyến đường chính có tổng mức đầu tư được duyệt là 12.182,1 tỷ đồng, giá trị hợp đồng BT được ký kết là 8.265,1 tỷ đồng, giá trị dự toán là 6.511,8 tỷ đồng (bằng 53,4% tổng mức đầu tư ban đầu).Kiểm toán Nhà nước kiến nghị giảm của 3 dự án 244,3 tỷ đồng. Đến thời điểm kiểm toán, cả 3 dự án đều chậm tiến độ (chậm từ 18 tháng đến gần 3 năm).Báo cáo gửi Quốc hội cũng nêu rõ, Dự án Nâng cấp đê biển tây tỉnh Cà Mau xử lý tài chính và xử lý khác 230,8 tỷ đồng (bằng 13,6% tổng mức đầu tư). Quá trình kiểm toán cho thấy, việc phê duyệt dự án đầu tư chưa khả thi nên phải điều chỉnh dự án và tổng mức đầu tư lên 1.697 tỷ đồng, tăng 84% so với ban đầu.Trước khi điều chỉnh, chủ đầu tư đã thực hiện xong hạng mục không phục vụ cho dự án, gây lãng phí ngân sách Nhà nước 25,4 tỷ đồng. Công tác phê duyệt thiết kế cơ sở vi phạm Luật Đê điều. Việc quản lý chất lượng công trình còn sai sót, ảnh hưởng đến tính an toàn của công trình và khu vực dân cư dọc kênh đào. Dự toán được duyệt còn nhiều sai sót làm tăng giá trị dự toán, việc thi công không đúng thiết kế nhưng vẫn lập hồ sơ nghiệm thu thanh toán.